Olivier Charbonnier voit le jour à Fontgombault le 16 août 1875 dans une famille d’instituteurs.
Très tôt initié aux sciences naturelles par son père, Olivier Charbonnier intègre l’Ecole Normale d’Instituteur de Châteauroux puis le monde de l’enseignement. Son premier poste le conduit à Saint-Germain-en Laye avant de revenir dans son Berry natal.